215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3746 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3260  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  93.88 
 
 		 392 aa  756    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3746  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  100 
 
 		 392 aa  800    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0605815  hitchhiker  0.0000012212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  56.68 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0979  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  50.84 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0400  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.33 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0534457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1535  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.66 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292172  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0937  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  48.83 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0897  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.67 
 
 		 365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1423  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.32 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1792  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  48.46 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.344281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4001  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.62 
 
 		 332 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  hitchhiker  0.00239808 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1610  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.82 
 
 		 308 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2036  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.35 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128879  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1710  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.53 
 
 		 332 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3756  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.16 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0179  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.76 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3517  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit X  41.99 
 
 		 335 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2052  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.07 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0401365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1293  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.16 
 
 		 331 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2980  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.45 
 
 		 322 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551452  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0262  chlorophyllide reductase, BchX subunit  45.99 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1906  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.99 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195312  normal  0.342059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6437  bacteriochlorophyllide reductase subunit  43.68 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2957  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.32 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  0.106043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2730  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.32 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2852  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.43 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2818  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.53 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292291  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3697  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44 
 
 		 334 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  37.75 
 
 		 731 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  37.68 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  33.57 
 
 		 290 aa  158  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  39.16 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0280  NifH/frxC  40.45 
 
 		 728 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.359044  normal  0.513981 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  36.4 
 
 		 292 aa  153  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  38.4 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  38.18 
 
 		 288 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  34.28 
 
 		 292 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  34.28 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  34.07 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  36.36 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  36.36 
 
 		 292 aa  149  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  37.35 
 
 		 251 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  41.15 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  38.18 
 
 		 270 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  35.32 
 
 		 299 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  35.5 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  40.44 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  36.3 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  34.93 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  39.04 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.22 
 
 		 268 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  34.44 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  38.19 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  41.1 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  35.09 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  33.58 
 
 		 264 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.22 
 
 		 289 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  39.27 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  37.22 
 
 		 289 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  39.11 
 
 		 289 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  39.56 
 
 		 289 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  37.12 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  35.77 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  39.21 
 
 		 274 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1813  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  38.06 
 
 		 276 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0326  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.67 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0117283  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2192  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.93 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  36.84 
 
 		 288 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  36.4 
 
 		 274 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  34.3 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  33.09 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  35.9 
 
 		 280 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  37.78 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  35.77 
 
 		 274 aa  138  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  36.33 
 
 		 275 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0217  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.36 
 
 		 276 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  36.36 
 
 		 272 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  39.27 
 
 		 290 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.77 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2386  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.67 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  42.19 
 
 		 288 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  34.55 
 
 		 289 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  39.83 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  39.09 
 
 		 276 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  38.36 
 
 		 276 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  38.16 
 
 		 299 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.4 
 
 		 248 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  34.53 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2027  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  37 
 
 		 275 aa  135  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0592137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  38.36 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  41.33 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  38.01 
 
 		 274 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  34.77 
 
 		 275 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  37.56 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2258  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.14 
 
 		 275 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00421326  normal  0.488321 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  37.56 
 
 		 274 aa  133  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  33.1 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  36.56 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  36.56 
 
 		 274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  33.58 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>