58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0817 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0817  methyltransferase type 11  100 
 
 
282 aa  566  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4465  methyltransferase type 11  79.7 
 
 
269 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375613  normal  0.0124267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1187  methyltransferase type 11  58.5 
 
 
265 aa  287  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4407  methyltransferase type 11  53.03 
 
 
270 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1727  Methyltransferase type 11  48.39 
 
 
260 aa  249  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.312488  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2036  Methyltransferase type 11  54.58 
 
 
255 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2049  methyltransferase type 11  54 
 
 
266 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4299  methyltransferase type 11  52 
 
 
266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0755  Methyltransferase type 11  49.62 
 
 
270 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12641  methyltransferase  51.72 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  31.7 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 
248 aa  125  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
254 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  30.22 
 
 
253 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  30.22 
 
 
253 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3339  methyltransferase  27.22 
 
 
239 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  26.52 
 
 
239 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3590  hypothetical protein  26.26 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  25.97 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  26.52 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  25 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  25 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
207 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3376  hypothetical protein  25.56 
 
 
239 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
207 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3641  hypothetical protein  25.56 
 
 
239 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  30.24 
 
 
271 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  27.93 
 
 
776 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3269  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.67 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  29.56 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
239 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
178 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
212 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 
232 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  25.48 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  27.89 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.13 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.46 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.44 
 
 
207 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
195 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.07 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  31.31 
 
 
355 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  34.45 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.04 
 
 
276 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
203 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  27.74 
 
 
189 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  22.39 
 
 
301 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  29.08 
 
 
204 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
259 aa  42  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>