52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2496 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2496  putative signal peptide protein  100 
 
 		 151 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.538855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2759  conserved hypothetical signal peptide protein  72 
 
 		 155 aa  230  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.30249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2356  putative signal peptide protein  71.81 
 
 		 155 aa  229  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  50.65 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  50.65 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  52.94 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  51.56 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2085  hypothetical protein  37.76 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.97593  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0552  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0440  hypothetical protein  46.88 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0447  hypothetical protein  46.88 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1247  hypothetical protein  34.44 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670192 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2317  periplasmic protein  40 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1705  periplasmic protein  40 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1037  hypothetical protein  41.67 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229002  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0830  hypothetical protein  41.67 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0320  hypothetical protein  41.67 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0275977  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920  hypothetical protein  41.67 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.367365  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1190  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1198  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.276892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.103854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1350  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0980  hypothetical protein  41.57 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5659  periplasmic protein  38.75 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2340  periplasmic protein  38.75 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2356  periplasmic protein  37.5 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2236  periplasmic protein  37.5 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0960  periplasmic protein  36.59 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0084  hypothetical protein  43.75 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.476638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2941  hypothetical protein  41.07 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  32.05 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  32.05 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  32.05 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0036  hypothetical protein  28.4 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2379  putative lipoprotein  41.51 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.163248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1725  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2663  hypothetical protein  39.62 
 
 		 105 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0170256  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1557  lysozyme inhibitor  38.33 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.833119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1727  lysozyme inhibitor  38.33 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0360001  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1617  lysozyme inhibitor  38.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  0.640497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1544  lysozyme inhibitor  38.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.412708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1896  lysozyme inhibitor  38.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  40.68 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  40.68 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  40.68 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  40.68 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1831  lysozyme inhibitor  40.68 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  40.68 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1849  lysozyme inhibitor  40.68 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000107016  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01599  hypothetical protein  40.68 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01609  predicted lipoprotein  40.68 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 100 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>