32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2407 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  70.77 
 
 		 233 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  70.77 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  56.06 
 
 		 229 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  57.58 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  49.23 
 
 		 245 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  49.23 
 
 		 245 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  49.23 
 
 		 245 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  49.23 
 
 		 245 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  49.23 
 
 		 245 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  49.23 
 
 		 245 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  49.23 
 
 		 245 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  49.23 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  49.18 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  45.9 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  45.9 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  46.88 
 
 		 243 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  45.16 
 
 		 241 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  40.62 
 
 		 235 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  51.56 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  51.56 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  51.56 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  51.56 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  42.19 
 
 		 243 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  49.21 
 
 		 246 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  44.62 
 
 		 289 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  51.56 
 
 		 246 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  43.75 
 
 		 240 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  42.19 
 
 		 239 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  42.42 
 
 		 239 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  33.85 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>