More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2158 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  634    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  94.41 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  94.74 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  77.96 
 
 		 304 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  78.62 
 
 		 304 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  48.33 
 
 		 301 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  46.36 
 
 		 305 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  45 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  45.51 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  44.88 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45 
 
 		 300 aa  278  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  45.75 
 
 		 300 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  46.23 
 
 		 304 aa  278  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  45.7 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  42.62 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.9 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.7 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  44.92 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  39.74 
 
 		 302 aa  246  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  40.46 
 
 		 306 aa  241  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  37.12 
 
 		 259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  33.91 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 		 538 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.17 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  30.67 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.19 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  31.8 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  31.93 
 
 		 253 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  35.38 
 
 		 554 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  30.2 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  33.04 
 
 		 255 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  31.67 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.18 
 
 		 237 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  34.21 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  34.6 
 
 		 564 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  34.78 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  28.69 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.5 
 
 		 470 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  34.76 
 
 		 466 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  30.7 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.57 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  31.43 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.47 
 
 		 247 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  33.18 
 
 		 425 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  29.15 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  34.98 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.58 
 
 		 438 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.65 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3425  hypothetical protein  34.07 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  31.15 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  29.88 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 269 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  28.88 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.74 
 
 		 611 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  31.39 
 
 		 597 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  30.28 
 
 		 245 aa  99  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  29.55 
 
 		 469 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  31.1 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  28.74 
 
 		 241 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  31.03 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3865  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.63 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  29.53 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  28.92 
 
 		 250 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 		 259 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0002  protein serine/threonine phosphatase  29.61 
 
 		 617 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.818409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  29.41 
 
 		 250 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  34.09 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  34.08 
 
 		 449 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  31.1 
 
 		 256 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  28.43 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  29.29 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  30.89 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  29.13 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  31.51 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  30 
 
 		 445 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  34.55 
 
 		 389 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  28.35 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  33.04 
 
 		 259 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  31.74 
 
 		 463 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  29.07 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0785  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.17 
 
 		 247 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  29.8 
 
 		 500 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  29.17 
 
 		 467 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  30.89 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  30.89 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  29.39 
 
 		 264 aa  92.8  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  29.52 
 
 		 633 aa  92.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  29.13 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1278  protein phosphatase 2C-like protein  29.8 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  32.72 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 419 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  31.75 
 
 		 507 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 		 416 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1303  protein phosphatase 2C-like protein  29.8 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.73 
 
 		 239 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>