18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1427 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1427  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  350  8e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0220837  hitchhiker  0.00312062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1304  putative transmembrane protein  75.42 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1368  hypothetical protein  73.74 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.75302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  37.84 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  37.79 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  32.52 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  30.64 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2289  putative transmembrane protein  30 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  26.82 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  30.54 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  29.51 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  27.65 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  29.63 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  27.49 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  27.59 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3900  hypothetical protein  38.98 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  47.37 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>