More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3734 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3734  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 325 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.450327  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3467  inner-membrane translocator  100 
 
 		 325 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3353  hypothetical protein  96.62 
 
 		 325 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2841  monosaccharide-transporting ATPase  76 
 
 		 325 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2300  inner-membrane translocator  67.18 
 
 		 325 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.047503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2307  carbohydrate ABC transporter permease  41.07 
 
 		 340 aa  208  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2408  monosaccharide-transporting ATPase  41.07 
 
 		 340 aa  208  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3318  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0529  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  40.46 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1338  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3819  monosaccharide-transporting ATPase  42.37 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4369  monosaccharide-transporting ATPase  39.08 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4659  monosaccharide-transporting ATPase  38.63 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225069  normal  0.765727 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0388  sugar ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0347  sugar ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0394  sugar ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4061  monosaccharide-transporting ATPase  38.8 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3277  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5190  Monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3722  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 329 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4330  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.759057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0929  carbohydrate ABC transporter permease  36.65 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.306696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3400  monosaccharide-transporting ATPase  36.65 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3267  carbohydrate ABC transporter permease  36.34 
 
 		 329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  34.7 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4695  monosaccharide-transporting ATPase  35.02 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1268  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.68 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.14735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1405  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  34.59 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  36.7 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0366  carbohydrate ABC transporter permease  33.02 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0433  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.54 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3057  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  33.54 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.16 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.16 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0032  sugar ABC transporter, permease  33.13 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.81353  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  33.97 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0784  monosaccharide-transporting ATPase  34.38 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.65 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.78 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.78 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5312  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.78 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.78 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.78 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.78 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 835 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.47 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  33.03 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  34.19 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  34.19 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.47 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  32.91 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  32.65 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  33.01 
 
 		 345 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1375  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.91 
 
 		 345 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4617  Monosaccharide-transporting ATPase  34.92 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.91 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.14 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.35 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 340 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.84 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  31.66 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.44 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  31.44 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.97 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  30.42 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  33.96 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  33.78 
 
 		 333 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>