21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2059 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  93.82 
 
 		 1668 aa  2925    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  100 
 
 		 1673 aa  3265    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3791  hypothetical protein  87.16 
 
 		 1724 aa  1862    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3368  hypothetical protein  85.94 
 
 		 1724 aa  1793    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  92.85 
 
 		 1632 aa  1819    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  47.89 
 
 		 691 aa  352  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  50.89 
 
 		 820 aa  312  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  32.52 
 
 		 1451 aa  302  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  47.51 
 
 		 814 aa  208  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  47.22 
 
 		 813 aa  208  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  47.75 
 
 		 853 aa  197  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0452  pore-forming tail tip protein  40.78 
 
 		 1023 aa  169  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.102086  normal  0.725254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  30.77 
 
 		 717 aa  161  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1657  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1508 aa  157  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1611  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1507 aa  157  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  30.48 
 
 		 1906 aa  152  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  30.69 
 
 		 1835 aa  152  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  22.88 
 
 		 1707 aa  75.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1331  hypothetical protein  58.33 
 
 		 1655 aa  67.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  24.43 
 
 		 925 aa  53.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  32.77 
 
 		 1555 aa  47.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>