53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4764 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  249  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  69.05 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  67.46 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  68.75 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  67.97 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  65.87 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  66.41 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  48.41 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  48.15 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  48.15 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  44.83 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  43.97 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  49.57 
 
 		 127 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  47.71 
 
 		 119 aa  90.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  43.22 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  43.22 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  43.1 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  52.22 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  42.48 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  38.74 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  52.17 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  44.33 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  38.79 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  44.07 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  38.89 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  55.7 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  39.51 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  31.19 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  36.04 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  31.03 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  32.98 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  31.25 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  33.87 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  30.12 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  33.87 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  35.44 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  35.9 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  31.71 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  32.26 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  28.42 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  31.08 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  27.27 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  29.89 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  31.43 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  30 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  35.94 
 
 		 147 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  34.25 
 
 		 103 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  31.43 
 
 		 102 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  32.91 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  34.67 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  39.06 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>