More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4613 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 698 aa  1333    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.66 
 
 		 642 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160302  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1015  methyl-accepting chemotaxis protein  40.2 
 
 		 641 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03248  chemotaxis sensory transducer  39.2 
 
 		 635 aa  356  5.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.66 
 
 		 642 aa  355  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0858408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.67 
 
 		 644 aa  350  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.19 
 
 		 642 aa  321  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.44 
 
 		 639 aa  303  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 		 631 aa  258  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1451  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 		 648 aa  256  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0574  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.08 
 
 		 650 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.571634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2860  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 		 555 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 660 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  37.63 
 
 		 676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.45 
 
 		 660 aa  112  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 		 418 aa  111  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.457369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.13 
 
 		 658 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.69 
 
 		 565 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 		 681 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  30.42 
 
 		 658 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.83 
 
 		 564 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  29.97 
 
 		 660 aa  107  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  30.42 
 
 		 658 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  30.42 
 
 		 658 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.18 
 
 		 417 aa  106  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1487  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 		 659 aa  106  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000879913  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  29.13 
 
 		 658 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  30.65 
 
 		 660 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  30.42 
 
 		 658 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  30.1 
 
 		 660 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  29.13 
 
 		 658 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  30.65 
 
 		 660 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  35.16 
 
 		 543 aa  105  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  31.17 
 
 		 660 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0405  methyl-accepting chemotaxis protein  31.52 
 
 		 430 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  31.17 
 
 		 660 aa  104  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  30.1 
 
 		 658 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  29.93 
 
 		 660 aa  104  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  34.44 
 
 		 544 aa  104  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  29.93 
 
 		 660 aa  104  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.02 
 
 		 660 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0470  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.13 
 
 		 430 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.13 
 
 		 430 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 565 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  29.77 
 
 		 660 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  30.46 
 
 		 658 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.84 
 
 		 650 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4900  methyl-accepting chemotaxis protein  31.52 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0469  methyl-accepting chemotaxis protein  31.13 
 
 		 430 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0418  methyl-accepting chemotaxis protein  31.52 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0604  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 668 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.67 
 
 		 571 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0356  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 		 430 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0339  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 		 430 aa  102  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0342  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 		 430 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  29.08 
 
 		 658 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0370  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 		 430 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 554 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02368  hypothetical protein  34.43 
 
 		 472 aa  102  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3335  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 430 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  36.49 
 
 		 629 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.42 
 
 		 583 aa  101  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  30.8 
 
 		 660 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  30.8 
 
 		 660 aa  101  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  30.8 
 
 		 660 aa  101  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  30.8 
 
 		 660 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  30.8 
 
 		 660 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.08 
 
 		 431 aa  101  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.613067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  36.15 
 
 		 549 aa  101  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 		 672 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3196  methyl-accepting chemotaxis protein  31.79 
 
 		 428 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.02 
 
 		 430 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 598 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  32.79 
 
 		 480 aa  100  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  30.41 
 
 		 660 aa  100  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0070  methyl-accepting chemotaxis protein  38.59 
 
 		 547 aa  100  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.740118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  30.07 
 
 		 660 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  30.8 
 
 		 660 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.56 
 
 		 681 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 		 541 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  34.94 
 
 		 541 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  31.01 
 
 		 660 aa  100  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.54 
 
 		 694 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.67 
 
 		 561 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  30.07 
 
 		 660 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 568 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003409  methyl-accepting chemotaxis protein  34.8 
 
 		 467 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000050033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 554 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 554 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0170  methyl-accepting chemotaxis protein  29.52 
 
 		 543 aa  99.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.5 
 
 		 554 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001231  methyl-accepting chemotaxis protein  36.21 
 
 		 542 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.554422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 		 558 aa  99.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.83 
 
 		 416 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  33.66 
 
 		 645 aa  99  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.94 
 
 		 605 aa  99  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 819 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 		 554 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>