More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4609 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4609  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 290 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0764  MCP methyltransferase, CheR-type  62.77 
 
 		 286 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3302  MCP methyltransferase, CheR-type  62.36 
 
 		 274 aa  355  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2051  MCP methyltransferase, CheR-type  59.93 
 
 		 299 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156898  hitchhiker  0.000266106 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  50 
 
 		 284 aa  299  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2325  MCP methyltransferase, CheR-type  46.91 
 
 		 276 aa  279  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1011  chemotaxis protein methyltransferase CheR  45.62 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1849  Protein-glutamate O-methyltransferase  49.63 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.313486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2118  MCP methyltransferase, CheR-type  38.04 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  39.29 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  38.04 
 
 		 280 aa  199  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  35.11 
 
 		 291 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1457  protein-glutamate O-methyltransferase  37 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.36 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.29 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0747  MCP methyltransferase, CheR-type  37.14 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1152  protein-glutamate O-methyltransferase  36.46 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0762  MCP methyltransferase, CheR-type  37.19 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1573  MCP methyltransferase, CheR-type  36.46 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0438911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  33.92 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  33.57 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1198  protein-glutamate O-methyltransferase  36.3 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.112441  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0778  MCP methyltransferase, CheR-type  35.38 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  35.14 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.21 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  34.42 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1379  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 		 553 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0993  protein-glutamate O-methyltransferase  35.02 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2231  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4421  protein-glutamate O-methyltransferase  33.57 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  32.13 
 
 		 277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3195  TPR repeat-containing CheR-type MCP methyltransferase  35.45 
 
 		 463 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.13083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  36.12 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  33.57 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4168  response regulator receiver protein  36.06 
 
 		 622 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1988  Protein-glutamate O-methyltransferase  35.02 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  34.36 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2689  protein-glutamate O-methyltransferase  35.48 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2282  MCP methyltransferase, CheR-type  34.2 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.977677  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  36.26 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  35.98 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2820  MCP methyltransferase, CheR-type  33.83 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.353038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0089  MCP methyltransferase, CheR-type  31.41 
 
 		 283 aa  155  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  32.95 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  37.16 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  36.23 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1098  protein-glutamate O-methyltransferase  33.99 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  32.17 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2434  putative MCP methyltransferase, CheR1  33.6 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  29.73 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  33.72 
 
 		 285 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  34.47 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2174  protein-glutamate O-methyltransferase  35.23 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2823  MCP methyltransferase, CheR-type  36.2 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147208  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1065  MCP methyltransferase, CheR-type  31.3 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4164  MCP methyltransferase, CheR-type  32.71 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  36.76 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4052  MCP methyltransferase, CheR-type  32.71 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  34.22 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  33.7 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2937  MCP methyltransferase, CheR-type  32.74 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.324206  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  35.96 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.47 
 
 		 314 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2115  protein-glutamate O-methyltransferase  37.6 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2459  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 		 502 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143998  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2915  MCP methyltransferase, CheR-type  36.56 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0347833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  30.71 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.47 
 
 		 315 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2731  MCP methyltransferase, CheR-type  35.84 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.377322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.92 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1405  chemotaxis protein methyltransferase  32.62 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.0669102 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.09 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.09 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  34.09 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.09 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  34.11 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1481  MCP methyltransferase, CheR-type  34.69 
 
 		 513 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  35.36 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  32.71 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2244  protein-glutamate O-methyltransferase  36.89 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00847323  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1772  MCP methyltransferase, CheR-type  29.39 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  31.4 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  35.29 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  35.29 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  35.29 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0647  chemotaxis protein methyltransferase  30.51 
 
 		 271 aa  146  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.63831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2124  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.19 
 
 		 277 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2101  MCP methyltransferase, CheR-type  36.89 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.60784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0185  MCP methyltransferase, CheR-type  36.03 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2030  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  31.89 
 
 		 481 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  34.09 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1610  MCP methyltransferase, CheR-type  31.66 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  31.29 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  30.27 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  33.86 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  31.94 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>