28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0672 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2749  hypothetical protein  29.38 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  28.04 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3148  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.02 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2282  hypothetical protein  28.39 
 
 		 406 aa  93.2  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  23.01 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  25.51 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  24.42 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  26.03 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3294  cellulose biosynthesis protein CelD  25.21 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421998  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  25.22 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0249  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.91 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.801675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  22.11 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0382  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  22.6 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  22.74 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4604  hypothetical protein  22.49 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  21.27 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2360  cellulose biosynthesis protein CelD  24.32 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4322  Tetratricopeptide domain protein  28 
 
 		 550 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3993  Tetratricopeptide domain protein  24.1 
 
 		 550 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1200  hypothetical protein  23.71 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  25.71 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2374  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  25.42 
 
 		 359 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3221  hypothetical protein  23.45 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978135  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2504  hypothetical protein  21.48 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1388  hypothetical protein  23.46 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.480209  normal  0.0990972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2729  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.27 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.052022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2824  cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.27 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>