More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2115 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2115  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.322248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3304  enoyl-CoA hydratase  86.33 
 
 
256 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3943  enoyl-CoA hydratase  76.95 
 
 
256 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3576  enoyl-CoA hydratase  69.14 
 
 
256 aa  361  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5245  enoyl-CoA hydratase  53.17 
 
 
258 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5107  enoyl-CoA hydratase  52.96 
 
 
258 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014973  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4225  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1660  enoyl-CoA hydratase  48.8 
 
 
254 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0508475  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4618  enoyl-CoA hydratase  46.03 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.246511  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0802  enoyl-CoA hydratase  48.52 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
261 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.17 
 
 
259 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.66 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.77 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
269 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
265 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.22 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  32.38 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.8 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  32.65 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  32.65 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.65 
 
 
261 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
261 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 
280 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.38 
 
 
269 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.51 
 
 
260 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
272 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
259 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
272 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.63 
 
 
257 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.63 
 
 
257 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 
260 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 
257 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 
260 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
252 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 
256 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.3 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.57 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
267 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  30.99 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 
260 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 
257 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.17 
 
 
260 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
258 aa  118  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
258 aa  118  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
258 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
258 aa  118  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.88 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  32.49 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  32.49 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.93 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  29.91 
 
 
263 aa  116  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 
264 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  32.49 
 
 
258 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.33 
 
 
270 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  28.69 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.58 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
268 aa  116  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.17 
 
 
260 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  28.69 
 
 
258 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  30.58 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  30.33 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  30.58 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  30.17 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  30.17 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.19 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.8 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.65 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  30.29 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.62 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>