More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1138 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  67.11 
 
 		 311 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  67.44 
 
 		 311 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  64.77 
 
 		 299 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  66.33 
 
 		 316 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  65 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  68.01 
 
 		 297 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  63.97 
 
 		 297 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  60.94 
 
 		 302 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  60.94 
 
 		 301 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  60.8 
 
 		 301 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  60.33 
 
 		 301 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  61.46 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  58.78 
 
 		 301 aa  363  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  59.67 
 
 		 306 aa  345  8e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  59 
 
 		 306 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  58.19 
 
 		 301 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  58.28 
 
 		 299 aa  338  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  54.21 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.66 
 
 		 298 aa  299  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  47.68 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  47.84 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  48.33 
 
 		 296 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  45.7 
 
 		 302 aa  272  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  43.85 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  47.85 
 
 		 302 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  45.36 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  45.07 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  44.74 
 
 		 298 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  44.74 
 
 		 298 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  44.7 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  43.83 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  30.59 
 
 		 474 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  30.59 
 
 		 459 aa  85.5  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  30.59 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  30.59 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  30.59 
 
 		 456 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  32.35 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  30.59 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  30.59 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  28.42 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  26.7 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2407  amidophosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.848054  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  30.73 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  28.37 
 
 		 553 aa  76.6  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  30.94 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0708  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  42.42 
 
 		 612 aa  76.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  32.6 
 
 		 493 aa  75.5  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2453  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  39.47 
 
 		 606 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.633572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.08 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  29.87 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0189  amidophosphoribosyltransferase  30.52 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0227  amidophosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  28.42 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  31.32 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 496 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0206  amidophosphoribosyltransferase  30.52 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.71 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 494 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 494 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  30.22 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1408  amidophosphoribosyltransferase  30.32 
 
 		 446 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0008  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 		 607 aa  72.8  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666294  normal  0.382171 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0106  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  32.82 
 
 		 604 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0427631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  28.89 
 
 		 492 aa  72.4  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 471 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  27.42 
 
 		 465 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  28.65 
 
 		 488 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 		 610 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.14 
 
 		 610 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  29.91 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0980  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.44 
 
 		 599 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  30.73 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0809  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  39.8 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00887379  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.91 
 
 		 605 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  30.06 
 
 		 529 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3498  amidophosphoribosyltransferase  28.99 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349457  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0841  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.44 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.121546  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1309  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.72 
 
 		 605 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3627  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.91 
 
 		 605 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.23 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 609 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3302  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  31.4 
 
 		 608 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  28.18 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  26.84 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0144451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>