More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0444 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0444  PfkB  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  88.46 
 
 		 312 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  76.92 
 
 		 312 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  51.77 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  51.77 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  56.13 
 
 		 312 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  48.71 
 
 		 311 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  50.49 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  48.39 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  48.72 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  51.63 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  46.67 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  51.14 
 
 		 473 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  44.52 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  47.23 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  47.23 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  50.81 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  50.81 
 
 		 442 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  50.81 
 
 		 449 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  50.81 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  47.56 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  44.19 
 
 		 311 aa  255  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  52.04 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  46 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  46 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  46 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  45.67 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  42.16 
 
 		 311 aa  238  6.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  44.66 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  43.61 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  42.86 
 
 		 332 aa  225  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  43.67 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  43.81 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  42.58 
 
 		 309 aa  222  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  42.58 
 
 		 309 aa  222  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  42.58 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  42.58 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  42.58 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  41.9 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  41.9 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  41.9 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  42.58 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  42.58 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  42.26 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  41.59 
 
 		 310 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  41.59 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  42.26 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  41.12 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  38.33 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2334  6-phosphofructokinase  40.39 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1009  ribokinase-like domain-containing protein  40.39 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  35.05 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  35.67 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1592  ribokinase-like domain-containing protein  39.43 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  36.99 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  34.23 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  33.56 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.7 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.05 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  37.54 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  37.42 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  35.24 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33.77 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.48 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  32.16 
 
 		 310 aa  143  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  36.95 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  34.84 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 		 318 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  35.92 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  30.97 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.82 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  30.42 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.55 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  30.07 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  30.1 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  34.33 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  30.1 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  31.27 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  34.33 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  30.1 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  30.1 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  31.07 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  36 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  30.21 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  32.17 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  31.46 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  29.56 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  35.44 
 
 		 317 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1711  ribokinase-like domain-containing protein  37.3 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  30.74 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>