285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3232 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3450  capsular polysaccharide biosynthesis protein  92.26 
 
 		 364 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3232  polysaccharide export protein  100 
 
 		 362 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.549213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  46.96 
 
 		 371 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  43.98 
 
 		 379 aa  288  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  36.92 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  36.97 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.61 
 
 		 378 aa  206  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 393 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  36.34 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  33.43 
 
 		 379 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  33.43 
 
 		 379 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  33.43 
 
 		 379 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.43 
 
 		 379 aa  202  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  33.43 
 
 		 379 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.62 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.43 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.15 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  32.69 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  35.48 
 
 		 373 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  34.48 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.51 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.98 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  33.9 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  33.7 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  33.7 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  34.64 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  32.71 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  30.29 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  31.09 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  34.23 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  30.55 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  30.55 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  33.61 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  34.38 
 
 		 378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.69 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.69 
 
 		 379 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  33.25 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  34.1 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  31.86 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  32.69 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  32.68 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  33.22 
 
 		 317 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  32.66 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  32.32 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.57 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  31.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  31.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  32.66 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  31.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  31.86 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  32.38 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.25 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  35.26 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  33.07 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  35.71 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  31.99 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  32.79 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  31.17 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  31.17 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  31.17 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  32.57 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.12 
 
 		 348 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.12 
 
 		 348 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.12 
 
 		 351 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  36.52 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  31.16 
 
 		 417 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  31.16 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.83 
 
 		 400 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.51 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.05 
 
 		 422 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  30.72 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  32.4 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  31.35 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  34.81 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  33.15 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  30.67 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 426 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  31.1 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  33.68 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  32.07 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  30.39 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  38.19 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  31.37 
 
 		 385 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  31.37 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  33.64 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  36.94 
 
 		 348 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  34.29 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  31.66 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>