235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0302 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0302  heat shock protein, Hsp33  100 
 
 
326 aa  675    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0333  Hsp33 protein  94.17 
 
 
326 aa  639    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2069  Hsp33 protein  77.63 
 
 
309 aa  478  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  39.34 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  38.44 
 
 
297 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  38.11 
 
 
297 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  38.96 
 
 
297 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  39.29 
 
 
284 aa  202  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  37.83 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  38.89 
 
 
300 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  37.91 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  38.36 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  38.28 
 
 
286 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  36.66 
 
 
290 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  38.61 
 
 
286 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  38.61 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  38.61 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  37.1 
 
 
293 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  37.05 
 
 
286 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  37.05 
 
 
286 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  37.05 
 
 
286 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  37.05 
 
 
286 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  36.77 
 
 
293 aa  187  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  36.07 
 
 
286 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  36.77 
 
 
293 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  36.36 
 
 
300 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  36.66 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  36.54 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  38.67 
 
 
291 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  37.74 
 
 
290 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  36.49 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  36.45 
 
 
286 aa  178  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  37.46 
 
 
289 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  34.52 
 
 
291 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  36.01 
 
 
292 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  34.19 
 
 
291 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  33.99 
 
 
297 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  37.75 
 
 
286 aa  176  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  35.71 
 
 
299 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  36.48 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  35.39 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  34.52 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  35.06 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  35.71 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  36.3 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  35.58 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  34.41 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  35.58 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  35.58 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  35.58 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  36.81 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  35.69 
 
 
292 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  35.69 
 
 
292 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  35.69 
 
 
292 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  35.69 
 
 
292 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  35.58 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  34.63 
 
 
289 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  34.84 
 
 
291 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  35.9 
 
 
294 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  35.9 
 
 
294 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  35.9 
 
 
294 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  35.06 
 
 
296 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  35.9 
 
 
294 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  35.58 
 
 
294 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  34.08 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  33.55 
 
 
289 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  35.26 
 
 
294 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  32.7 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  32.7 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  32.7 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  32.7 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  32.7 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  32.7 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  32.7 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  34.08 
 
 
297 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1179  Hsp33 protein  33.64 
 
 
322 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3187  Hsp33 protein  34.38 
 
 
322 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1163  Hsp33 protein  34.6 
 
 
339 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  31.6 
 
 
296 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  30.89 
 
 
316 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  33.66 
 
 
293 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  31.53 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  32.25 
 
 
281 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  32.06 
 
 
316 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  32.14 
 
 
281 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1648  Hsp33-like chaperonin  32.47 
 
 
286 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00511557  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  31.21 
 
 
316 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2652  Hsp33 protein  32.52 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  31.21 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5111  Hsp33 protein  32.22 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.950978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  30.89 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1319  Hsp33 protein  31.71 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3451  Hsp33 protein  32.53 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  30.89 
 
 
316 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  29.3 
 
 
316 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01668  chaperonin HslO  33.65 
 
 
296 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0911997  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  29.91 
 
 
316 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1148  Hsp33 protein  31.73 
 
 
286 aa  143  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.279106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1240  heat shock protein HSP33  31.73 
 
 
286 aa  143  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1058  Hsp33 protein  33.54 
 
 
334 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>