36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2300 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  58.37 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  55.13 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  52.12 
 
 		 237 aa  241  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  41.51 
 
 		 225 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  35.58 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  35.62 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  35.47 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  34.07 
 
 		 235 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  34.07 
 
 		 235 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  33.82 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  43.14 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  31.6 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  31.6 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  43.14 
 
 		 226 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  43.14 
 
 		 226 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  31.66 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  31.16 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  29.85 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  33.52 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  28.88 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  34.7 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  33.55 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  33.71 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  33.76 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  29.1 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  30.07 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  30.07 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  31.61 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  31.61 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  31.61 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  29.25 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  29.24 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  24.89 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0007  protein of unknown function DUF1275  29.08 
 
 		 230 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00254664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  24.27 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>