32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1790 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 387 aa  795    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  69.09 
 
 		 372 aa  531  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  68.55 
 
 		 373 aa  533  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.86 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.86 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  45.19 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.37 
 
 		 355 aa  299  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.39 
 
 		 359 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  45.51 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.75 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.1 
 
 		 325 aa  272  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.58 
 
 		 354 aa  262  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.58 
 
 		 365 aa  255  8e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.74 
 
 		 353 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.16 
 
 		 353 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  42.14 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.93 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.77 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.76 
 
 		 314 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.19 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.68 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  21.52 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  21.08 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.56 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.36 
 
 		 356 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  19.75 
 
 		 337 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 		 327 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.22 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.83 
 
 		 808 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  23.08 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.01 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.66 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>