19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0373 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0373  hypothetical protein  100 
 
 		 928 aa  1892    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4855  hypothetical protein  54.29 
 
 		 934 aa  967    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0348  hypothetical protein  95.58 
 
 		 928 aa  1813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0413  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1074 aa  193  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5119  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1076 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1496 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  23.2 
 
 		 1497 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  20.78 
 
 		 1495 aa  62  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1498 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1498 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4425  hypothetical protein  20.66 
 
 		 1148 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.669526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4884  hypothetical protein  20.6 
 
 		 768 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  23.76 
 
 		 1439 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  23.06 
 
 		 1439 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1565 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1571 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  21.34 
 
 		 1395 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1275 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1530 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>