More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3846 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
314 aa  643    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  87.58 
 
 
314 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  86.94 
 
 
314 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  87.58 
 
 
314 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  68.47 
 
 
314 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  68.2 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  66.56 
 
 
316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  63.06 
 
 
326 aa  394  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  43.86 
 
 
326 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 
307 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  36.24 
 
 
307 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  38.61 
 
 
304 aa  229  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  36.91 
 
 
307 aa  228  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  36.79 
 
 
307 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  35.91 
 
 
307 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  35.91 
 
 
307 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  36.58 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  41.39 
 
 
327 aa  225  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 
307 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  37 
 
 
308 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  37.33 
 
 
306 aa  222  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  35.23 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  35.23 
 
 
307 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  35.55 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  40.78 
 
 
306 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  34.44 
 
 
313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  37.09 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  40.4 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  38 
 
 
323 aa  196  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  38 
 
 
314 aa  195  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  37.21 
 
 
316 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 
314 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  35.91 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  29.37 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 
309 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  38.78 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  33.89 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  30.3 
 
 
301 aa  167  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 
324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  33.8 
 
 
314 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  29.15 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  32.03 
 
 
308 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  33.79 
 
 
313 aa  159  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
305 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
310 aa  156  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
305 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  32.98 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
306 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  32.2 
 
 
334 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
298 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 
335 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 
276 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
277 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  31.06 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  31.06 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  31.06 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  29.57 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  34.47 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  30.17 
 
 
279 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  33.45 
 
 
288 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  30.79 
 
 
288 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
279 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 
275 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  27.55 
 
 
308 aa  102  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
270 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  29.71 
 
 
279 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  28.82 
 
 
277 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 
278 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  31.03 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  29.01 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  28.85 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  29.47 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
267 aa  92.4  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  26.69 
 
 
279 aa  92.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  28.25 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  28.01 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  28.01 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0801  Lysophospholipase-like protein  24.19 
 
 
296 aa  90.5  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  28.01 
 
 
280 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  28.01 
 
 
280 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  28.71 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  28.71 
 
 
303 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  29.11 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  28.98 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  22.83 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  29.55 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
281 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
268 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  28.87 
 
 
318 aa  85.9  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>