More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1730 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1730  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  330  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1890  AsnC family transcriptional regulator  81.08 
 
 		 112 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2400  AsnC family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4638  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4423  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3584  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3944  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2142  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.390853  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3838  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277809  normal  0.961023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3321  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 154 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  42.31 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  44.27 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  44.27 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.31 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  44.27 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  45.04 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  43.08 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  42.31 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  46.03 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  42.31 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  44.27 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  44.27 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  44.27 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  46.77 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  40.88 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  38 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  44.62 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 172 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 169 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  40.88 
 
 		 167 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  43.51 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  40.88 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  40.77 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  41.61 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  40.88 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  42.75 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  42.75 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  42.31 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  44.63 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  42.75 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  40.77 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  42.75 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  43.08 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  44.62 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4408  proline-responsive regulatory protein  40.48 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  40.88 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 196 aa  100  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  42.37 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  41.8 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 163 aa  97.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03072  leucine responsive regulatory protein  44.17 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0927  leucine-responsive regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.23 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2815  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  35.8 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  35.8 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  35.8 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  35.8 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  35.8 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>