More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1852 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1852  pyruvate kinase  100 
 
 
473 aa  969    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  79.28 
 
 
473 aa  772    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1475  pyruvate kinase  64.9 
 
 
481 aa  632  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2959  pyruvate kinase  62.79 
 
 
477 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4085  pyruvate kinase  55.81 
 
 
485 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.951837  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1642  pyruvate kinase  56.45 
 
 
485 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.774037  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1478  pyruvate kinase  49.58 
 
 
475 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1801  pyruvate kinase  49.58 
 
 
474 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0175  pyruvate kinase  46.88 
 
 
477 aa  435  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281463  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0383  pyruvate kinase  44.98 
 
 
465 aa  436  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0469  pyruvate kinase  45.34 
 
 
477 aa  423  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0582  pyruvate kinase  43.94 
 
 
477 aa  410  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0527  pyruvate kinase  45.71 
 
 
499 aa  397  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1867  pyruvate kinase  43.58 
 
 
477 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  41.74 
 
 
584 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  40.72 
 
 
582 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  43.72 
 
 
585 aa  353  4e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  42.37 
 
 
476 aa  350  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  42.86 
 
 
480 aa  347  2e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  39.96 
 
 
583 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  39.15 
 
 
585 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  41.95 
 
 
482 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  44.52 
 
 
509 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  41.99 
 
 
583 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  42.06 
 
 
583 aa  339  8e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  41.44 
 
 
582 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  41.05 
 
 
590 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  42.55 
 
 
577 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  41.95 
 
 
482 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  43.51 
 
 
578 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  42.11 
 
 
585 aa  333  6e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  42.11 
 
 
585 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  42.11 
 
 
585 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  42.11 
 
 
585 aa  332  9e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  42.11 
 
 
585 aa  332  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  42.11 
 
 
585 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  38.77 
 
 
585 aa  332  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  41.87 
 
 
585 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  42.29 
 
 
478 aa  332  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  41.87 
 
 
585 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  42.11 
 
 
585 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  38.54 
 
 
585 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  40.83 
 
 
474 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  39.66 
 
 
485 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  43.74 
 
 
472 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  39.57 
 
 
485 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  38.54 
 
 
585 aa  331  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  38.12 
 
 
585 aa  330  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  41.9 
 
 
477 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  38.82 
 
 
588 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  41.81 
 
 
596 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  41.81 
 
 
596 aa  326  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  38.82 
 
 
471 aa  325  8.000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  41.57 
 
 
597 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  39.32 
 
 
474 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  40.79 
 
 
478 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  41.09 
 
 
596 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  42.34 
 
 
482 aa  322  8e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  40.71 
 
 
580 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  40.55 
 
 
476 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  38.87 
 
 
480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  42.03 
 
 
474 aa  319  7e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  42.25 
 
 
479 aa  319  9e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  39.75 
 
 
476 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  40.48 
 
 
601 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  40.18 
 
 
478 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  39.48 
 
 
594 aa  318  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2701  pyruvate kinase  40.09 
 
 
470 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  41.43 
 
 
605 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  41.57 
 
 
479 aa  317  3e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  38.68 
 
 
585 aa  317  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  41.08 
 
 
474 aa  316  5e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  39.29 
 
 
587 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  39.87 
 
 
470 aa  316  6e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  40.09 
 
 
483 aa  316  7e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  37.91 
 
 
580 aa  316  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  42 
 
 
472 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  40.66 
 
 
586 aa  315  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  42 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  39.75 
 
 
474 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  35.91 
 
 
580 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  38.54 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  39.48 
 
 
592 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  38.54 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  39.48 
 
 
592 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  38.54 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  38.57 
 
 
476 aa  313  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2441  pyruvate kinase  39.52 
 
 
470 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.47 
 
 
494 aa  313  5.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  40.39 
 
 
479 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  44.13 
 
 
491 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  40.74 
 
 
470 aa  312  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  43.57 
 
 
471 aa  312  7.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  37.53 
 
 
470 aa  312  9e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2744  pyruvate kinase  39.74 
 
 
491 aa  312  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1757  pyruvate kinase  40.17 
 
 
470 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.18747e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1955  pyruvate kinase  40.17 
 
 
470 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000401811  unclonable  0.000000014136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  41 
 
 
472 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2390  pyruvate kinase  40.17 
 
 
470 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000743671  hitchhiker  0.0000173681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  40.17 
 
 
470 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>