More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0029 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0029  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0406  response regulator receiver protein  79.37 
 
 		 126 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0854  response regulator receiver protein  77.97 
 
 		 124 aa  193  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3403  response regulator receiver protein  72.95 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.809384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3466  response regulator receiver protein  74.58 
 
 		 125 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3179  response regulator receiver domain-containing protein  72.88 
 
 		 120 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.164981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3253  response regulator  71.19 
 
 		 123 aa  166  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2959  two component signal transduction response regulator  58.47 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.888929  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0458  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0187  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.283319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1426  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3609  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2332  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1110  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 117 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2829  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2366  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 385 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000342445  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2558  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 473 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.26 
 
 		 473 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.26 
 
 		 473 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 247 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  36.89 
 
 		 241 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1644  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 235 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1472  putative transcriptional regulatory protein OmpR  36.89 
 
 		 241 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.830233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 234 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3323  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.68 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  36.72 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 253 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 244 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.51 
 
 		 461 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 243 aa  71.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  38.58 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3178  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 232 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  35.77 
 
 		 248 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 232 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 232 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 232 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 232 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 232 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 232 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1503  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3422  two component transcriptional regulator  43.31 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.51 
 
 		 494 aa  69.3  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0931  response regulator receiver protein  46.59 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2506  sensory box protein/sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.74 
 
 		 564 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.92979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 483 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  38.79 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  38.95 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  38.95 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  36.75 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.48 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.48 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  37.29 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  37.01 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  37.01 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1759  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  40 
 
 		 912 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2412  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.18168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 721 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  37.29 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  33.33 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.52 
 
 		 472 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 492 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 246 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.59 
 
 		 236 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>