More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2598 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
418 aa  864    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
446 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  22.97 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
395 aa  93.6  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
353 aa  92.8  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 
396 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2681  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
423 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
539 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
385 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0105  glycosyltransferase-like protein  24.15 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.88 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  35 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.24 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
458 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  23.97 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.27 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.84 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2078  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  24.19 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  21.58 
 
 
406 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1744  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  28.33 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0297  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.67 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  31.58 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  21.25 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  21.33 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.65 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  20.81 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  22.63 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  21.45 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>