More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1915 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  100 
 
 		 399 aa  813    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  61.94 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  58.16 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  57.95 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  49.61 
 
 		 412 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  45.57 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  46.95 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  45.94 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  44.92 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  45.18 
 
 		 394 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  44.33 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  44.1 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  42.71 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  43.59 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  43.4 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  43.32 
 
 		 398 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  43.37 
 
 		 400 aa  312  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  42.75 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  45.2 
 
 		 399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  43.4 
 
 		 403 aa  308  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  42.6 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  44.33 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  45.27 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  43.26 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  43.08 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  43.14 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  44.5 
 
 		 393 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  44.19 
 
 		 389 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  43.12 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  43.25 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  41.94 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  42.75 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  44.79 
 
 		 390 aa  300  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  44.19 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5272  acetate kinase  42.71 
 
 		 386 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  41.79 
 
 		 410 aa  295  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  41.77 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  42.3 
 
 		 371 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  42.35 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  42.35 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1346  acetate kinase  41.12 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429911  normal  0.010894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  41.71 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  39 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  43.34 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  40.1 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  38.35 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  43.08 
 
 		 396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  42.38 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  41.15 
 
 		 402 aa  286  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  41.84 
 
 		 391 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  41.73 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  42.71 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  41.06 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  40.97 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  42.82 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  37.28 
 
 		 397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  41.48 
 
 		 1305 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  40.59 
 
 		 408 aa  282  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  39.95 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  40.92 
 
 		 391 aa  279  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  38.81 
 
 		 402 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  37.91 
 
 		 397 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  35.73 
 
 		 404 aa  279  8e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  41.25 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  40.3 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  37.56 
 
 		 405 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  41 
 
 		 404 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  40.25 
 
 		 402 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  37.97 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  37.97 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  37.97 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  40 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  37.97 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  37.97 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  36.52 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  39.79 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  39.79 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  38.75 
 
 		 399 aa  272  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  38.07 
 
 		 396 aa  272  9e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  38.42 
 
 		 396 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  37.56 
 
 		 403 aa  272  9e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  37.31 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  38.42 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  41.71 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  42.61 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  36.18 
 
 		 401 aa  270  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  38.85 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  35.44 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  42.27 
 
 		 399 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  35.77 
 
 		 398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  36.9 
 
 		 397 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  37.31 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  37.94 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  36.18 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  37.82 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  41.04 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  36.66 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  36.64 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  36.9 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  35.93 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>