20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0057 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0057  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 326 aa  680    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0071  helix-turn-helix domain-containing protein  73.93 
 
 		 335 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4861  transcriptional regulator, XRE family  48.62 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000181011  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5326  helix-turn-helix domain-containing protein  40.67 
 
 		 328 aa  252  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000585614  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0030  hypothetical protein  30.46 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  34.1 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2502  transcriptional regulator, XRE family  30.2 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000318024  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2797  transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000983915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2426  hypothetical protein  26.41 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1215  helix-turn-helix domain-containing protein  23.27 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  30.3 
 
 		 183 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1643  phage-associated protein-like protein  20.57 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1155  phage-associated protein  27.53 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0121884  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0419  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 189 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000615648 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0762  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359066  normal  0.554709 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0353  prophage ps3 protein 01, putative  28.42 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000627364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2895  Putative phage-associated protein  30.11 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9916  hypothetical protein  25.5 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0459  Putative phage-associated protein  21.33 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.20482 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1940  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>