36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1625 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1625  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  293  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0455  integral membrane protein-like protein  34.06 
 
 		 198 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0275  hypothetical protein  34.06 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0543  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229816  normal  0.930595 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6177  integral membrane protein-like  34.04 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2765  integral membrane protein-like protein  34.06 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2903  integral membrane protein-like protein  34.06 
 
 		 174 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2859  integral membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 161 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.804583 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2848  integral membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 174 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2234  integral membrane protein-like  33.33 
 
 		 174 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.288425  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0425  hypothetical protein  32.37 
 
 		 171 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3198  hypothetical protein  32.37 
 
 		 171 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0671  hypothetical protein  32.37 
 
 		 171 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286215  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2848  hypothetical protein  32.37 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0506  hypothetical protein  32.37 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0488  hypothetical protein  32.37 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0171  hypothetical protein  32.37 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1421  hypothetical protein  32.37 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1244  putative transmembrane protein  34.56 
 
 		 166 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.82251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3182  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 190 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0361  hypothetical protein  32.26 
 
 		 171 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4393  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427837  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0313  transmembrane protein  34.69 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3596  putative transmembrane protein  33.88 
 
 		 185 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0260  hypothetical protein  36.36 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0877  putative transmembrane protein  28.15 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0111  hypothetical protein  31.3 
 
 		 247 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3048  hypothetical protein  28.08 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000244651  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1592  hypothetical protein  30.65 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.37459  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0136  hypothetical protein  31.3 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3012  hypothetical protein  27.97 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.51732  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0324  transmembrane protein  24.66 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0115837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3556  hypothetical protein  28.43 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.217786  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0338  hypothetical protein  23.57 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0382  hypothetical protein  23.48 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>