More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0187 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0187  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  862    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.691069  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0203  protein of unknown function DUF21  89.28 
 
 		 429 aa  768    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.228231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  58.23 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  58 
 
 		 424 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2824  hypothetical protein  55.29 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000593821  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3664  hypothetical protein  52 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000481216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0097  hypothetical protein  52.98 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000140223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0579  hypothetical protein  52.98 
 
 		 457 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2817  hypothetical protein  52.27 
 
 		 497 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.292015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0482  hypothetical protein  51.64 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000251302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2654  hypothetical protein  54.85 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0452813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0505  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  54.34 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175643  normal  0.331146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3451  protein of unknown function DUF21  53.83 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00533306  hitchhiker  0.000732193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0549  hypothetical protein  53.2 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000304401  normal  0.0362947 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2530  CBS domain-containing protein  51.54 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3252  putative transporter  51.54 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3526  CBS domain-containing protein  51.67 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1310  CBS domain-containing protein  51.54 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1137  CBS domain-containing protein  51.07 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3505  putative transporter  51.54 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0452  CBS domain-containing protein  51.54 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3530  putative transporter  51.54 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0507  hypothetical protein  51.89 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000590838  normal  0.67931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  48.81 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0640  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  45.97 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  46.63 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  42.21 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2371  transmembrane protein  44.85 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.242025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  41 
 
 		 428 aa  342  8e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  41.02 
 
 		 430 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  39.71 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  37.8 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  40.15 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  40 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  39.13 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  40.15 
 
 		 428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  39.66 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  39.3 
 
 		 423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  38.92 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  39.86 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  38.81 
 
 		 423 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  38.61 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0510  hypothetical protein  39.81 
 
 		 420 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.17258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  38.81 
 
 		 423 aa  302  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1429  transporter  39.76 
 
 		 419 aa  300  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.836538  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  38.96 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  38 
 
 		 423 aa  299  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  39.26 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  38.92 
 
 		 423 aa  298  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03483  hypothetical protein  39.54 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  39.27 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  36.82 
 
 		 427 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  38.52 
 
 		 413 aa  296  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  39.01 
 
 		 424 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  39.01 
 
 		 424 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  37.87 
 
 		 424 aa  296  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  38.52 
 
 		 413 aa  296  6e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  39.01 
 
 		 424 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  39.01 
 
 		 424 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  38.9 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  38.9 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  38.9 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  38.9 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  38.42 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  37.84 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  37.84 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  36.36 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  37.41 
 
 		 417 aa  289  6e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  37.16 
 
 		 417 aa  289  7e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  37.62 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  37.62 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  37.62 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  38.37 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  37.62 
 
 		 413 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  38.54 
 
 		 426 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  37.38 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02501  predicted inner membrane protein  38.46 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02465  hypothetical protein  38.46 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000805698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  37.19 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  37.59 
 
 		 424 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  36.97 
 
 		 421 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  36.8 
 
 		 421 aa  272  9e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  36.56 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  35.34 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02692  hypothetical protein  37.82 
 
 		 394 aa  264  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000130738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1200  metal dependent phosphohydrolase  36.74 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0996  hypothetical protein  35.31 
 
 		 428 aa  256  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1370  hypothetical protein  36.41 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  33.25 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  31.48 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  32.03 
 
 		 442 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  33.42 
 
 		 437 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  32.03 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15930  hemolysin  36.32 
 
 		 430 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467501  normal  0.32719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  31.19 
 
 		 435 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  32.72 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  29.83 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  31.96 
 
 		 438 aa  206  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  32.82 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  30.66 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>