68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4940 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4940  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 462 aa  940    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857933  normal  0.500548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4356  filamentation induced by cAMP protein Fic  58.33 
 
 		 443 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.871364  normal  0.139855 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3262  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.26 
 
 		 466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.793632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3106  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.08 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3558  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.15 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4224  hypothetical protein  40.07 
 
 		 352 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.440664  normal  0.329944 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1097  hypothetical protein  29.01 
 
 		 346 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.149406  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0913  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.27 
 
 		 245 aa  104  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.876617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.85 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.99 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.41 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.03 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2285  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.56 
 
 		 250 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0273  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.08 
 
 		 306 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.55 
 
 		 245 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.35 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10760  hypothetical protein  26.9 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.553511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.76 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  27.02 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  27.02 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0207  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.23 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576684 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.41 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.69 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  26.67 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.08 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1262  hypothetical protein  24.67 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.254788  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.11 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2694  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.67 
 
 		 76 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2094  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.91 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.21 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0357  Fic family protein  26.13 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2836  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.69 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.93 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  30.67 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  30.67 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.57 
 
 		 248 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  26.42 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.63 
 
 		 248 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0779  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.39 
 
 		 236 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  26.07 
 
 		 261 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  25.12 
 
 		 261 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3441  hypothetical protein  22.38 
 
 		 253 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2116  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.48 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.73 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.34 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1166  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.76 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0608775 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2915  hypothetical protein  20.29 
 
 		 253 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2657  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.1 
 
 		 233 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.37 
 
 		 393 aa  47.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.37 
 
 		 502 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1889  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.7 
 
 		 454 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.79 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.56 
 
 		 443 aa  47  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.04 
 
 		 395 aa  47  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4175  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.69 
 
 		 456 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.77 
 
 		 386 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.28 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.71 
 
 		 326 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3975  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.67 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186681  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.55 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.71 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2238  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.17 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76756  decreased coverage  0.000875847 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  26.86 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0774  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 228 aa  43.5  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000913684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.14 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0212a  Fic family protein  52.78 
 
 		 88 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00851652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>