28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3296 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3296  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  100 
 
 		 170 aa  356  9e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2903  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  58.29 
 
 		 203 aa  225  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188915  normal  0.371774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1743  glycoside hydrolase family protein  63.91 
 
 		 170 aa  224  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4113  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  56.68 
 
 		 203 aa  220  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2973  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  58.68 
 
 		 170 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2603  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  55.76 
 
 		 170 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369412  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  43.86 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2606  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  38.34 
 
 		 193 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00071357  unclonable  3.49737e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2640  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  38.34 
 
 		 193 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0502424  hitchhiker  0.00410144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  33.53 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  26.09 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  33.33 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  33.33 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  30.95 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  25.77 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  30.37 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  31.78 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  59.46 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  27 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  27 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  29.13 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 188 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  29.13 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>