More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3144 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  100 
 
 
400 aa  825    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  89.34 
 
 
400 aa  698    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  78.28 
 
 
402 aa  621  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  63.13 
 
 
402 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  62.6 
 
 
402 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  62.7 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  62.13 
 
 
397 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  62.7 
 
 
402 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  62.7 
 
 
402 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  61.07 
 
 
397 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  61.07 
 
 
397 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  61.07 
 
 
397 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  61.33 
 
 
397 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  60.65 
 
 
404 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  60.8 
 
 
397 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  59.79 
 
 
427 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  60.4 
 
 
403 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  45.83 
 
 
396 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  44.66 
 
 
397 aa  302  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  37.64 
 
 
401 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  38.1 
 
 
421 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  38.56 
 
 
413 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  39.95 
 
 
412 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.02 
 
 
414 aa  230  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  36.36 
 
 
396 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  36.59 
 
 
416 aa  226  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  37.7 
 
 
394 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  35.09 
 
 
400 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  35.04 
 
 
398 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  33.25 
 
 
395 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  35.69 
 
 
402 aa  216  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  35.97 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  33.75 
 
 
400 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  35.88 
 
 
412 aa  209  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  36.36 
 
 
430 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  34.84 
 
 
425 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  33.08 
 
 
395 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  34.81 
 
 
414 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  34.81 
 
 
414 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  34.3 
 
 
401 aa  206  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  34.92 
 
 
397 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  34.38 
 
 
403 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  33.25 
 
 
412 aa  202  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  34.12 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  34.35 
 
 
395 aa  199  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  32.82 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  35.75 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  34.52 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  32.15 
 
 
398 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  33.75 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  34.55 
 
 
391 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  32.82 
 
 
399 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  34.09 
 
 
404 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  32.88 
 
 
406 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  32.61 
 
 
407 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  34.81 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  35.59 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  36.36 
 
 
387 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  34.38 
 
 
377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 
400 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.46 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  30.56 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.33 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  34.25 
 
 
382 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.08 
 
 
406 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  28.94 
 
 
426 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  34.25 
 
 
382 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  30.48 
 
 
401 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  33.94 
 
 
382 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  34.04 
 
 
382 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  31.46 
 
 
389 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  30.23 
 
 
401 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
420 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  31.06 
 
 
384 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  34.1 
 
 
389 aa  167  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.77 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  32.93 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  32.93 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  29.95 
 
 
385 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  30.16 
 
 
385 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  32.63 
 
 
385 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
384 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  30.95 
 
 
397 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  32.21 
 
 
383 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  31.79 
 
 
378 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 
404 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  31.53 
 
 
385 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  31.8 
 
 
386 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  30.68 
 
 
506 aa  155  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  31.66 
 
 
410 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 
405 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  32 
 
 
390 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32 
 
 
391 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  34.64 
 
 
373 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32 
 
 
391 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  31.89 
 
 
373 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  31.23 
 
 
404 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  30.26 
 
 
711 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  30.03 
 
 
404 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  30.03 
 
 
422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>