More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2584 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
330 aa  664    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  33.98 
 
 
340 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  31.19 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  29.32 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  31.23 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
328 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  29.19 
 
 
329 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  31.83 
 
 
333 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
330 aa  109  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  30.97 
 
 
345 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
328 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  29.35 
 
 
347 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  29.03 
 
 
341 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  30.74 
 
 
338 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  28.48 
 
 
341 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
324 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  29.41 
 
 
336 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  29.08 
 
 
335 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  29.17 
 
 
363 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  28.44 
 
 
329 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  29.58 
 
 
332 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
355 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  28.94 
 
 
341 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  27.64 
 
 
329 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
361 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
331 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
324 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.68 
 
 
334 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
355 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  29.97 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
349 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
335 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
335 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  28.76 
 
 
335 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
335 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
335 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  29.64 
 
 
335 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.43 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.76 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.43 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.43 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.43 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  28.97 
 
 
336 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.43 
 
 
338 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.43 
 
 
338 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
346 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
346 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1770  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 
342 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.759605  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
358 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  26.46 
 
 
329 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  26.46 
 
 
329 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  28.34 
 
 
336 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  30.6 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
333 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  28.27 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.71 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
319 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 
335 aa  90.1  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.96 
 
 
322 aa  89.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
342 aa  89.4  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  28.76 
 
 
349 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
339 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.87 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.66 
 
 
327 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
329 aa  86.7  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
340 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.47 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0240  dihydroflavonol 4-reductase family protein  30.43 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00224634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.07 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  28.01 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2000  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.8 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  28.01 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  27.83 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.08 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.93 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1958  dihydroflavonol-4-reductase family protein  28.43 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10140  oxidoreductase  28.83 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2290  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>