64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1243 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 168 aa  346  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  65.48 
 
 		 171 aa  227  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  59.52 
 
 		 168 aa  208  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  66.67 
 
 		 166 aa  207  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  58.93 
 
 		 168 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  40.12 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.41 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.5 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  43.7 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.5 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.36 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  36.13 
 
 		 152 aa  85.1  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  39.02 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.94 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.52 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  36.07 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.94 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.94 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.94 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  40.34 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.94 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.94 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.94 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  36.21 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  42.34 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.38 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  33.56 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  34.96 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  35.54 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  35.25 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  35.25 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  32 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  34.15 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  34.33 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  35.2 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  36.52 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  34.59 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  33.83 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  24.24 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  32.48 
 
 		 124 aa  51.6  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  29.23 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.97 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  24.43 
 
 		 132 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  20.31 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  20.3 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  22.31 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  21.48 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  22.95 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  28.46 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  26.83 
 
 		 131 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.38 
 
 		 963 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  22.22 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  22.22 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  26.83 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  29.27 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.95 
 
 		 689 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.81 
 
 		 963 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1446  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0899389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  21.05 
 
 		 135 aa  41.2  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0520  hemerythrin-like metal-binding protein  29.41 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  24.63 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0525  hemerythrin-like metal-binding protein  29.41 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  21.77 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  24.79 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>