26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1062 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  60.63 
 
 		 290 aa  348  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  52.38 
 
 		 296 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  43.12 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  41.99 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  42.31 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  45.11 
 
 		 287 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  41.46 
 
 		 265 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  43.63 
 
 		 269 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  37.42 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  39.94 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  35.14 
 
 		 226 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  40.1 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  33.67 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  43 
 
 		 173 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  33.78 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  32.78 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  38.46 
 
 		 189 aa  143  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  42.68 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  47.96 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  48.1 
 
 		 97 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  65.52 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  54.55 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  50 
 
 		 355 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  48.57 
 
 		 349 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>