More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0697 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
365 aa  743    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  83.89 
 
 
358 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  74.73 
 
 
369 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  76 
 
 
363 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  71.83 
 
 
371 aa  528  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  66.49 
 
 
368 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  67.71 
 
 
375 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  66.02 
 
 
370 aa  485  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  66.76 
 
 
368 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  66.85 
 
 
396 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  63.79 
 
 
374 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  56.16 
 
 
366 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  56.16 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  56.23 
 
 
374 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  54.86 
 
 
356 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  55.59 
 
 
374 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  54.57 
 
 
356 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  54.86 
 
 
356 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  56.13 
 
 
374 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  54.39 
 
 
357 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  53.47 
 
 
357 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  53.8 
 
 
356 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  53.8 
 
 
356 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  54.09 
 
 
356 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  53.8 
 
 
356 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  54.09 
 
 
356 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  53.8 
 
 
356 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  53.8 
 
 
356 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  54.09 
 
 
364 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  54.09 
 
 
356 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  54.39 
 
 
357 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  54.39 
 
 
357 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  54.09 
 
 
357 aa  361  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  53.76 
 
 
357 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  44.03 
 
 
368 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  45.07 
 
 
363 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  45.76 
 
 
360 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  43.21 
 
 
365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  45.33 
 
 
365 aa  282  7.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  41.21 
 
 
365 aa  270  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  45.13 
 
 
359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  45.13 
 
 
359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  35.2 
 
 
360 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  37.58 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  34.86 
 
 
349 aa  200  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 
358 aa  196  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.83 
 
 
351 aa  196  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  31.91 
 
 
356 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 
351 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  34.84 
 
 
371 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  33.91 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  31.92 
 
 
358 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  34.5 
 
 
352 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  34.27 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  34.1 
 
 
352 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  35.38 
 
 
348 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.11 
 
 
357 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  36.06 
 
 
369 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  36.19 
 
 
355 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 
374 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  31.79 
 
 
349 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  34.36 
 
 
364 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  33.43 
 
 
363 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2341  class I/II aminotransferase  33.16 
 
 
382 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.416124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  34.26 
 
 
357 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.97 
 
 
370 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  31.09 
 
 
376 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2316  histidinol-phosphate aminotransferase  35.1 
 
 
374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2242  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  30.27 
 
 
371 aa  162  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
360 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  34.43 
 
 
356 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
360 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4228  aminotransferase class I and II  33.14 
 
 
347 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0323  aminotransferase class I and II  36.2 
 
 
347 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 
365 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 
355 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  28.48 
 
 
350 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  31.28 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
377 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  29.51 
 
 
357 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  30.48 
 
 
357 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  28.93 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4103  histidinol phosphate aminotransferase  32.85 
 
 
347 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4253  aminotransferase class I and II  32.65 
 
 
347 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377555  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  32.42 
 
 
373 aa  153  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  31 
 
 
363 aa  152  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22000  histidinol-phosphate aminotransferase  34.13 
 
 
380 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 
373 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  32.8 
 
 
375 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1030  histidinol-phosphate aminotransferase  31.79 
 
 
373 aa  149  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
365 aa  146  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3176  histidinol-phosphate aminotransferase  31.02 
 
 
378 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  30.54 
 
 
372 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000115352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 
453 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>