More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1357 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1357  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 351 aa  704    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1095  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.33 
 
 		 334 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.508014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1025  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.33 
 
 		 334 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.669152  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1538  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.21 
 
 		 313 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0672252  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0152  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.31 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00761409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.68 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.93 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 335 aa  391  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 330 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.95 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.95 
 
 		 346 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0049  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.54 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.603347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.41 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4544  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.076063  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.2 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.52 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.12 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.21 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.69 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.12 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.14 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.5 
 
 		 334 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.5 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.3 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.41 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.53 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.5 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.25 
 
 		 338 aa  381  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  55.02 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.01 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.86 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.04 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.93 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1909  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.01 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0928672  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.04 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.46 
 
 		 333 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.5 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.24 
 
 		 338 aa  381  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  56.06 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 		 363 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.25 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.37 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.37 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.13 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.05 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.85 
 
 		 341 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.12 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.79 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  55.7 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.92 
 
 		 351 aa  378  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.65 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0578  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.99 
 
 		 338 aa  381  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 338 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  56 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.66 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.37 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2353  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3407  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.16 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.72 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 		 321 aa  374  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.96 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1247  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0266  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.19 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.63 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2532  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.79 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3401  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3366  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.23 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1128  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2515  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.72 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.75499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.47 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>