57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1355 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
100 aa  189  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  51.52 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  51.52 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  39.39 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1540  protein of unknown function YGGT  45.83 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.180759  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  40.43 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  38.38 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  36.73 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  38.78 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0154  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  35.79 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  40.62 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  32.32 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  29.59 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  35.42 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1346  protein of unknown function YGGT  49.18 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000041237  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  40.28 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  40.28 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 
197 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  35 
 
 
107 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  28.89 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  30.95 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  30.95 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  27.78 
 
 
197 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  29.89 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  37.93 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  32.86 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  32.18 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2110  protein of unknown function YGGT  34.74 
 
 
191 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  30.68 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  30.23 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  28.99 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  38.82 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  26.6 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0580  hypothetical protein  35.53 
 
 
194 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.471121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3886  hypothetical protein  40.3 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843847  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  32.63 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 
199 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  38.82 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  36.14 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  40.51 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  31.82 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  35.21 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  32.86 
 
 
186 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  39.68 
 
 
86 aa  40.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  32.86 
 
 
186 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  34.88 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  27.06 
 
 
196 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  27.06 
 
 
196 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  29.41 
 
 
196 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  27.06 
 
 
196 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  27.06 
 
 
196 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>