29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1346 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1346  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
91 aa  173  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000041237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  46.75 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  43.24 
 
 
182 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  43.08 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  43.08 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  34.78 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4045  protein of unknown function YGGT  35.8 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000118098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  36.99 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  38.03 
 
 
93 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  38.46 
 
 
197 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  34.48 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  32.88 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
99 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  34.38 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2426  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 
187 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  34.72 
 
 
88 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 
199 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  35.14 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  34.43 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  35.38 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  32.31 
 
 
196 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  32.31 
 
 
196 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  34.67 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>