More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1157 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1157  co-chaperonin GroES  100 
 
 
89 aa  169  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1544  co-chaperonin GroES  78.65 
 
 
89 aa  110  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0431  co-chaperonin GroES  79.12 
 
 
92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000315226  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0416  co-chaperonin GroES  79.12 
 
 
92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000021476  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0053  co-chaperonin GroES  76.67 
 
 
90 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00191023  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0033  chaperonin Cpn10  60.92 
 
 
89 aa  95.9  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 
94 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
97 aa  94  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 
94 aa  94  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16391  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
103 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
94 aa  93.6  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  55.06 
 
 
88 aa  93.2  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02000  Chaperonin GroES (HSP10)  54.84 
 
 
94 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0662925  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
103 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1530  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 
103 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  52.75 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16271  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  50 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 
94 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16161  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.5001  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1035  co-chaperonin GroES  51.76 
 
 
86 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.281335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 
95 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
95 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  55.17 
 
 
89 aa  90.5  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  51.65 
 
 
94 aa  90.5  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
95 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  55.56 
 
 
98 aa  90.1  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  49.43 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  49.44 
 
 
93 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0225  chaperonin Cpn10  48.86 
 
 
88 aa  89.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15561  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 
103 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0969  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  47.92 
 
 
96 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18371  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0668  co-chaperonin GroES  47.06 
 
 
86 aa  88.2  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000199289  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  53.33 
 
 
98 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
97 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 
95 aa  87.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 
97 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 
97 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 
97 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05031  hypothetical protein  50 
 
 
166 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1501  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 
93 aa  87  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  50.56 
 
 
92 aa  87  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 
103 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
103 aa  87  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 
96 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  50 
 
 
96 aa  86.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0309  co-chaperonin GroES  48.24 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0556646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  47.37 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  47.37 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  47.37 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0505  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.31516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  50 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2138  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.580367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0934  co-chaperonin GroES  51.14 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  45.65 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  49.47 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  49.43 
 
 
92 aa  85.9  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  47.87 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 
96 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
98 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  42.71 
 
 
98 aa  85.9  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 
96 aa  84.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3290  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000053121  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 
96 aa  84.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1355  co-chaperonin GroES  45.88 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0510  co-chaperonin GroES  45.88 
 
 
86 aa  84.3  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2170  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.100099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1233  co-chaperonin GroES  45.88 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  43.75 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  52.22 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  43.16 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  45.83 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  46.32 
 
 
105 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 
104 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
103 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  45.36 
 
 
98 aa  84  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
96 aa  84.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  46.32 
 
 
105 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>