More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0416 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0431  co-chaperonin GroES  100 
 
 
92 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000315226  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0416  co-chaperonin GroES  100 
 
 
92 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000021476  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0053  co-chaperonin GroES  79.12 
 
 
90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00191023  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1157  co-chaperonin GroES  79.12 
 
 
89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1544  co-chaperonin GroES  81.32 
 
 
89 aa  107  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  58.24 
 
 
94 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0033  chaperonin Cpn10  60.87 
 
 
89 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
96 aa  100  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 
96 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  56.04 
 
 
94 aa  98.2  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  54.95 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  53.93 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
95 aa  97.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3290  chaperonin Cpn10  54.95 
 
 
95 aa  97.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000053121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
94 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0934  co-chaperonin GroES  54.44 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 
97 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
94 aa  95.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  50 
 
 
96 aa  94.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  52.75 
 
 
94 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1501  chaperonin Cpn10  50.54 
 
 
93 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 
97 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 
97 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 
97 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
96 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  50.56 
 
 
91 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
95 aa  93.6  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  55.56 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  50.55 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  49.48 
 
 
98 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0391  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  49.48 
 
 
101 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
97 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 
96 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  53.41 
 
 
98 aa  92  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  50.57 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  52.22 
 
 
103 aa  91.7  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  53.85 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 
96 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  49.43 
 
 
93 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1055  co-chaperonin GroES  48.31 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2494  chaperonin Cpn10  54.95 
 
 
87 aa  90.9  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000670366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
95 aa  90.9  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1035  co-chaperonin GroES  49.44 
 
 
86 aa  90.5  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.281335  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  48.45 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
95 aa  90.5  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1355  co-chaperonin GroES  49.43 
 
 
86 aa  90.5  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1233  co-chaperonin GroES  49.43 
 
 
86 aa  90.5  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000377642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  51.11 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  48.31 
 
 
92 aa  89.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  47.42 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0510  co-chaperonin GroES  49.43 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  51.04 
 
 
100 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 
103 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 
103 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  52.22 
 
 
103 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 
95 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  47.83 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0668  co-chaperonin GroES  47.19 
 
 
86 aa  88.6  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000199289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  53.33 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  51.11 
 
 
103 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 
96 aa  88.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  48.35 
 
 
97 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02000  Chaperonin GroES (HSP10)  52.69 
 
 
94 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0662925  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 
97 aa  88.2  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  46.67 
 
 
102 aa  88.2  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 
96 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 
96 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  45.05 
 
 
102 aa  88.2  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0225  chaperonin Cpn10  50 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 
96 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  53.33 
 
 
94 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 
95 aa  87.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 
95 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  46.74 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  45.65 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 
94 aa  87.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  50 
 
 
94 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2523  chaperonin Cpn10  47.83 
 
 
104 aa  87.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>