More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0053 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0053  co-chaperonin GroES  100 
 
 
90 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00191023  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0431  co-chaperonin GroES  79.12 
 
 
92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000315226  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0416  co-chaperonin GroES  79.12 
 
 
92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000021476  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1157  co-chaperonin GroES  76.67 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1544  co-chaperonin GroES  75.56 
 
 
89 aa  104  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  55.56 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  52.08 
 
 
96 aa  98.6  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 
95 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
97 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
97 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
97 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 
95 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 
96 aa  95.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 
96 aa  94.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 
96 aa  94.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 
96 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 
94 aa  94  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  50 
 
 
94 aa  93.6  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  47.92 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  50 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0033  chaperonin Cpn10  56.18 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 
96 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02000  Chaperonin GroES (HSP10)  52.69 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0662925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 
95 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  49.46 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  46.39 
 
 
98 aa  92  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  49.47 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 
96 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  47.83 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  50.56 
 
 
91 aa  90.9  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 
96 aa  91.3  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
96 aa  90.5  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1322  chaperonin Cpn10  47.73 
 
 
95 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.071778  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  46.88 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1233  co-chaperonin GroES  47.67 
 
 
86 aa  89.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000377642  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1355  co-chaperonin GroES  47.67 
 
 
86 aa  89.4  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  50 
 
 
94 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 
95 aa  89.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 
96 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  48.31 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 
96 aa  88.6  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
96 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0510  co-chaperonin GroES  47.67 
 
 
86 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  51.09 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  50.57 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  45.83 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2494  chaperonin Cpn10  52.22 
 
 
87 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000670366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1345  chaperonin Cpn10  47.73 
 
 
95 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.234338  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  51.09 
 
 
94 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  46.74 
 
 
95 aa  88.2  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  51.09 
 
 
94 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  50 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  50 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  50 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  50 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  50 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  50 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
95 aa  87.8  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  50 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  50 
 
 
94 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  46.39 
 
 
101 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  49.47 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 
97 aa  87.8  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 
104 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 
94 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2138  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.580367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  45.36 
 
 
100 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1035  co-chaperonin GroES  46.07 
 
 
86 aa  86.7  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.281335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 
95 aa  86.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05031  hypothetical protein  48.89 
 
 
166 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  48.31 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  45.36 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  48.96 
 
 
100 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  47.92 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  47.78 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  43.16 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  47.83 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>