More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0073 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
294 aa  586  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
292 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01288  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.85 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01299  hypothetical protein  38.85 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1426  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71913  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1811  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1521  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1956  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.798746  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
291 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.270526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
414 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00128894  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
300 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
295 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657903  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
296 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
319 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198584  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
416 aa  159  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.27612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
291 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.476032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
262 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
307 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
304 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.707606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
314 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
316 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 
312 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
299 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
293 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
304 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
293 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
319 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
317 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0740262  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  35.66 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
312 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
319 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
328 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  35.34 
 
 
293 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 
325 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 
325 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
435 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
323 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
293 aa  148  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
300 aa  149  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.177688  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
314 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  31.6 
 
 
318 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
299 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
311 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.68 
 
 
294 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
320 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.292649  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.69 
 
 
318 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.19 
 
 
317 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
315 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
309 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
286 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3673  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.1 
 
 
308 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246744  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
305 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
312 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
308 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166359  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
310 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
315 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.41 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  35.29 
 
 
305 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
321 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
311 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421015  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
315 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0566045  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04590  permease component of ABC-type sugar transporter  32.18 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.61 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.52 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
330 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
324 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  32.42 
 
 
294 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
317 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  hitchhiker  0.000478367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1088  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32 
 
 
288 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  hitchhiker  0.00755847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1104  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.2 
 
 
334 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204963  normal  0.0432036 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
283 aa  138  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
320 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.811069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.02 
 
 
321 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
307 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0281  ABC transporter, inner membrane subunit  30.07 
 
 
292 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
311 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
317 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>