More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2634 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  73.21 
 
 		 448 aa  693    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  100 
 
 		 448 aa  922    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  76.47 
 
 		 451 aa  708    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  75.28 
 
 		 448 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  76.42 
 
 		 448 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  73.66 
 
 		 448 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  74.83 
 
 		 448 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  74.83 
 
 		 448 aa  690    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  76.42 
 
 		 448 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  76.87 
 
 		 448 aa  701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  74.83 
 
 		 448 aa  690    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  73.44 
 
 		 448 aa  693    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1253  glutamine synthetase, catalytic region  57.24 
 
 		 454 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  38.8 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  39.02 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  39.25 
 
 		 458 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  39.25 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  38.14 
 
 		 458 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  37.69 
 
 		 458 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  37.92 
 
 		 458 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  38.34 
 
 		 460 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  37.69 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  38.34 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  38.34 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  37.25 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  37.47 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  37.89 
 
 		 460 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  37.89 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  37.03 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  37.47 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  37.44 
 
 		 459 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  38.72 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  36.76 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  36.67 
 
 		 461 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  37.42 
 
 		 472 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  37.33 
 
 		 472 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  37.33 
 
 		 472 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  37.33 
 
 		 472 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  37.33 
 
 		 472 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  37.33 
 
 		 472 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  37.33 
 
 		 472 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  37.33 
 
 		 472 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  36.89 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  36.53 
 
 		 472 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  36.44 
 
 		 472 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  36.98 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  36.99 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  38.52 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  36.16 
 
 		 455 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  36.38 
 
 		 455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  35.71 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  34.37 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  34.61 
 
 		 465 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  35.41 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  35.92 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  35.19 
 
 		 454 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  35.11 
 
 		 454 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  36.44 
 
 		 445 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  36.44 
 
 		 445 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  36.44 
 
 		 445 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  36.14 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  35.79 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  36.44 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  36.22 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  35.86 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  34.3 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  33.03 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  35.86 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  35.86 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  35.86 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  35.86 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  35.7 
 
 		 490 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  35.63 
 
 		 444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  35.63 
 
 		 456 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  33.63 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  34.25 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  35.12 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  33.77 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  33.56 
 
 		 452 aa  224  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  33.63 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  33.41 
 
 		 463 aa  223  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  35.12 
 
 		 454 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  33.41 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  36.72 
 
 		 456 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  33.41 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  33.41 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  33.55 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  34.4 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  33.48 
 
 		 452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  34.72 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  33.64 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  33.48 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  33.33 
 
 		 476 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  34.08 
 
 		 455 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  34.17 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  34.37 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0800  glutamine synthetase  34.25 
 
 		 478 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  32.82 
 
 		 452 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  33.85 
 
 		 454 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  34.08 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>