23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2079 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2079  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  457  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.970801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2565  hypothetical protein  66.06 
 
 
238 aa  301  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182499  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1345  hypothetical protein  57.99 
 
 
224 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2440  major paralogous domain protein  58.53 
 
 
222 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0884  hypothetical protein  55.8 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1284  major paralogous domain protein  47.93 
 
 
230 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0926983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0481  major paralogous domain protein  49.73 
 
 
221 aa  193  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  46.86 
 
 
360 aa  191  7e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0863  major paralogous domain protein  43.85 
 
 
245 aa  190  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  0.340408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0434  hypothetical protein  48.63 
 
 
232 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436298  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1563  major paralogous domain  41.45 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.398386  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2181  major paralogous domain protein  42.13 
 
 
223 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1562  major paralogous domain  43.78 
 
 
197 aa  158  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.632869  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0482  hypothetical protein  47.49 
 
 
207 aa  154  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0523  hypothetical protein  42.78 
 
 
223 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0460  hypothetical protein  43.55 
 
 
217 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1586  hypothetical protein  39.49 
 
 
250 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.812157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0870  major paralogous domain protein  35.48 
 
 
219 aa  145  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878684  normal  0.0381164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2424  hypothetical protein  42.13 
 
 
212 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1157  hypothetical protein  38.89 
 
 
251 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.299926 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1658  hypothetical protein  34.23 
 
 
202 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2976  hypothetical protein  29.49 
 
 
228 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0094  major paralogous domain protein  29.13 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.718944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>