54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4006 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4006  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 353 aa  714    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2521  extracellular solute-binding protein  33.23 
 
 		 340 aa  145  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  31.45 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  34.07 
 
 		 349 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  30.08 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  27.91 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 355 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  31.25 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  30.56 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  30.56 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  21.8 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  20.13 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 382 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 343 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.36 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  22.5 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  23.91 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  19.14 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  23.67 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0812  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 136 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  19.14 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 345 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 366 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 341 aa  43.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  22.71 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>