24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1863 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 462 aa  953    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  30.2 
 
 		 490 aa  222  9e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  30.24 
 
 		 420 aa  173  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  24.94 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  25.99 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  25.97 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  24.13 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  28.08 
 
 		 419 aa  110  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  23.72 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  25.58 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  25.52 
 
 		 608 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  23.87 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  26.04 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  25.77 
 
 		 458 aa  57  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  20.47 
 
 		 934 aa  56.6  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  23.63 
 
 		 447 aa  53.9  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  25.18 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  26.87 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0739  hypothetical protein  26.87 
 
 		 574 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  26.88 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2464  Pyrrolo-quinoline quinone  29.84 
 
 		 605 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.23 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  27.16 
 
 		 612 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  25.4 
 
 		 444 aa  43.1  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>