46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0646 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0646  metal-dependent phosphohydrolase HD region  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2048  hypothetical protein  44.94 
 
 
181 aa  147  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177115  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3397  metal dependent phosphohydrolase  46.89 
 
 
182 aa  141  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.142821 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0493  hypothetical protein  44 
 
 
183 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00081908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0902  hypothetical protein  44 
 
 
183 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000021002  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1764  hypothetical protein  44 
 
 
183 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1907  hypothetical protein  44 
 
 
183 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000528754  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0861  hypothetical protein  44 
 
 
183 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000231552  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0590  hypothetical protein  43.43 
 
 
183 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3204  metal dependent phosphohydrolase  44.07 
 
 
183 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5072  hypothetical protein  43.33 
 
 
186 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000114516  normal  0.171306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1098  HD phosphohydrolase-like protein  42.37 
 
 
182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1868  hypothetical protein  41.44 
 
 
186 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000237894  normal  0.181864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4796  hypothetical protein  41.99 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166036  hitchhiker  0.000000743072 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4655  HD phosphohydrolase-like protein  43.02 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4974  HD phosphohydrolase-like protein  40.88 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000007057  normal  0.341441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0354  HD phosphohydrolase-like  43.02 
 
 
183 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128726  normal  0.751455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5294  HD phosphohydrolase-like protein  40.33 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000027923  normal  0.0177067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3073  HD phosphohydrolase-like  40.33 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121385  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3429  HD phosphohydrolase-like protein  41.01 
 
 
183 aa  131  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520585  normal  0.0636711 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5183  HD phosphohydrolase-like protein  41.57 
 
 
183 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124512  normal  0.526767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1065  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  42.22 
 
 
186 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0772  hypothetical protein  42.7 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2988  hypothetical protein  49.7 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12561  hypothetical protein  35.59 
 
 
201 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.818417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3530  metal dependent phosphohydrolase  44.38 
 
 
183 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0136008 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0334  hypothetical protein  38.8 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.169528  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0718  phosphonate degradation operons associated HDIG domain protein  48.47 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.066077  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27880  hypothetical protein  41.3 
 
 
193 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4180  hypothetical protein  44.83 
 
 
177 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2353  hypothetical protein  41.08 
 
 
193 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1923  hypothetical protein  41.76 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.293049  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2276  hypothetical protein  41.76 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4690  hypothetical protein  45.14 
 
 
189 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5187  metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 
182 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1995  hypothetical protein  40.12 
 
 
200 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5365  hypothetical protein  37.21 
 
 
188 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1303  hypothetical protein  39.75 
 
 
162 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2968  metal dependent phophohydrolase  36.53 
 
 
195 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000380455  hitchhiker  0.000533169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1317  HD phosphohydrolase-like protein  40.36 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11251  hypothetical protein  34.59 
 
 
200 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.14726 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1186  HD phosphohydrolase-like protein  41.67 
 
 
184 aa  91.7  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0055  HD phosphohydrolase-like  43.15 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.203088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2635  metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.910617  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2010  metal-dependent phosphohydrolase  34.9 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211956  normal  0.0444683 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3336  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>