More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2704 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3345  glycerol kinase  61.74 
 
 		 495 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  100 
 
 		 497 aa  1019    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4386  glycerol kinase  61.74 
 
 		 496 aa  632  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.248951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18010  putative glycerol kinase  61.34 
 
 		 494 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00302845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2618  glycerol kinase  61.54 
 
 		 495 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1564  glycerol kinase  61.34 
 
 		 494 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  59.55 
 
 		 501 aa  604  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0386  glycerol kinase  60.65 
 
 		 498 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.791585  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0443  glycerol kinase  60.45 
 
 		 498 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.59607  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4501  glycerol kinase  59.23 
 
 		 497 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.212836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1966  glycerol kinase  60.04 
 
 		 507 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1239  glycerol kinase  60.65 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1200  glycerol kinase  58.54 
 
 		 493 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.279675  normal  0.769167 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5976  glycerol kinase  58.42 
 
 		 500 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6463  glycerol kinase  58.42 
 
 		 500 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.977008  normal  0.690577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  60.04 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3683  glycerol kinase  59.27 
 
 		 489 aa  590  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.625574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2319  glycerol kinase  57.93 
 
 		 493 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160007  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1320  glycerol kinase  57.81 
 
 		 493 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2662  glycerol kinase  57.61 
 
 		 493 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2859  glycerol kinase  57.61 
 
 		 497 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0360  glycerol kinase  57.4 
 
 		 503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3440  glycerol kinase  56.68 
 
 		 494 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3131  glycerol kinase  57.61 
 
 		 497 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7067  glycerol kinase  58.22 
 
 		 500 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.417411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3316  glycerol kinase  58.62 
 
 		 497 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0281  glycerol kinase  57.4 
 
 		 519 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00242  probable carbohydrate kinase  55.78 
 
 		 494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3953  glycerol kinase  56.3 
 
 		 494 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2809  glycerol kinase  58.27 
 
 		 497 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.507542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2231  glycerol kinase  56.25 
 
 		 529 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.633532  normal  0.0750986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3544  glycerol kinase  56.59 
 
 		 500 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  57.52 
 
 		 496 aa  571  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3420  glycerol kinase  55.69 
 
 		 519 aa  568  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  56.1 
 
 		 520 aa  564  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  55.78 
 
 		 513 aa  558  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  53.04 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1763  glycerol kinase  57.81 
 
 		 501 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.197449  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  57.2 
 
 		 505 aa  559  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  53.24 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  56.36 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3533  glycerol kinase  54.75 
 
 		 497 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1141  glycerol kinase  53.41 
 
 		 514 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.125497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  52.53 
 
 		 497 aa  551  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1011  glycerol kinase  53.43 
 
 		 501 aa  551  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00463589  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  53.97 
 
 		 498 aa  550  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  53.16 
 
 		 499 aa  545  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  53.16 
 
 		 498 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  53.16 
 
 		 498 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4226  glycerol kinase  57 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0545781  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  53.44 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  53.44 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  53.44 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  53.44 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  53.44 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2009  glycerol kinase  56.71 
 
 		 495 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.904533  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  53.44 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  53.44 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  53.44 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  54.25 
 
 		 494 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  52.43 
 
 		 503 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  53.24 
 
 		 502 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2675  glycerol kinase  53.02 
 
 		 498 aa  541  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.732872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  52.43 
 
 		 518 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  52.43 
 
 		 503 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  53.81 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  52.43 
 
 		 518 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  54.38 
 
 		 496 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  52.43 
 
 		 518 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  53.24 
 
 		 502 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  55.47 
 
 		 496 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  52.43 
 
 		 518 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  53.97 
 
 		 496 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  52.43 
 
 		 518 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  55.76 
 
 		 496 aa  538  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  53.25 
 
 		 507 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  53.54 
 
 		 493 aa  538  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  52.83 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  52.63 
 
 		 499 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  53.25 
 
 		 507 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  52.83 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  52.23 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  53.02 
 
 		 501 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  52.83 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  52.02 
 
 		 499 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  51.51 
 
 		 495 aa  537  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  54.07 
 
 		 503 aa  537  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  53.25 
 
 		 507 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  52.83 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  52.83 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  54.51 
 
 		 505 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  51.32 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  51.62 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  53.16 
 
 		 510 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  51.32 
 
 		 501 aa  535  1e-150  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  53.46 
 
 		 503 aa  531  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  55.62 
 
 		 501 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  53.12 
 
 		 495 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  53.32 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  51.62 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>