20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2467 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2467  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  441  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  40.09 
 
 		 212 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2968  hypothetical protein  44.17 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3581  Asp/Glu racemase  36.11 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.265944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1505  hypothetical protein  37.44 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449573  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2141  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.63 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.594037  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6847  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.05 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0128  hypothetical protein  32.44 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  36.6 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2745  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.39 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  33.18 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0436  Asp/Glu racemase  30.92 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4733  hypothetical protein  34.42 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6752  hypothetical protein  31.34 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.607582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3408  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.22 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000155733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2768  hypothetical protein  31.53 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  36.74 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2913  hypothetical protein  20.41 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.719661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3133  hypothetical protein  20.41 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>